Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms