Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ift43Q9DA69 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ift43Q9DA69 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms