Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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