Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms