Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmd12Q9D8W5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd12Q9D8W5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms