Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms