Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms