Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Echdc3Q9D7J9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms