Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns2Q9D7J7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capns2Q9D7J7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms