Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T2

4921524L21Rik, MCG15536, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921524L21RikQ9D5T2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4921524L21RikQ9D5T2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4921524L21RikQ9D5T2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms