Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms