Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc130Q9D516 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms