Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf6Q9D4J7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf6Q9D4J7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms