Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efhd1Q9D4J1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efhd1Q9D4J1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms