Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms