Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms