Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms