Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K2

Oxct1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct1Q9D0K2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Oxct1Q9D0K2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Oxct1Q9D0K2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Oxct1Q9D0K2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Oxct1Q9D0K2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Oxct1Q9D0K2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms