Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acer3Q9D099 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acer3Q9D099 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms