Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CenpnQ9CZW2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CenpnQ9CZW2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms