Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Polr3eQ9CZT4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms