Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms