Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms