Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rrs1Q9CYH6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrs1Q9CYH6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms