Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx7Q9CY18 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx7Q9CY18 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx7Q9CY18 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx7Q9CY18 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Snx7Q9CY18 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms