Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms