Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Utp23Q9CX11 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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