Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Khdc3Q9CWU5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc3Q9CWU5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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