Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms