Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms