Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ctrb1Q9CR35 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctrb1Q9CR35 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms