Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Nicn1Q9CQM0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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