Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rdm1Q9CQK3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rdm1Q9CQK3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Rdm1Q9CQK3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rdm1Q9CQK3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Rdm1Q9CQK3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms