Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snrpb2Q9CQI7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snrpb2Q9CQI7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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