Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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