Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQC3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms