Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms