Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NsmfQ99NF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms