Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf17Q99MV7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf17Q99MV7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms