Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gdpd3Q99LY2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms