Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms