Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5lQ99LH9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Sh3bp5lQ99LH9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5lQ99LH9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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