Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf34Q99KR6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms