Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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TrabdQ99JY4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TrabdQ99JY4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms