Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tlcd1Q99JT6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms