Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfxn1Q99JR1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms