Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcoln1Q99J21 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mcoln1Q99J21 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms