Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Cldn16Q925N4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn16Q925N4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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