Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alpk3Q924C5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alpk3Q924C5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms