Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nrif1Q923B3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms